Deunan est une experte en missions commandos : elle évolue dans un monde en guerre depuis des années. Elle ignore que sa lutte est sans enjeu car le monde est revenu à une période de paix qu'instaure progressivement des nations émergentes comme Olympus, la cité modèle.
Hitomi aidée par les forces spéciales d'Olympus extirpe Deunan de sa jungle urbaine et la font venir dans la cité, pour l'intégrer au SWAP, une équipe de super- policiers.
Elle y retrouve Briareos, un de ses anciens compagnons de guerre, qui, blessé est devenu un cyborg.
La population d'Olympus se compose majoritairement de bioroïds, des humains créés artificiellement, dont on a limité les émotions et qui sont incapables de procréer.
[Ils sont de parfaits sujets pour la société modèle surveillée par Gaïa, un super ordinateur lui-même aux mains de sept sages].
Athena, une bioroïd, dirige Olympus d'une main ferme mais elle doit prendre des desision en accord avec les militaires, des hommes naturels n'éprouvant que mépris ou peur face aux bioroïds qui, selon eux, menacent la survie de l'espèce humaine. La situation politique devient rapidement explosive et Deunan se retrouve prise à partie dans les affrontements.
Un filme magnifique fait pas l'auteur de Ghost in the shel